Rules governing the genetic code degeneracy/redundancy and spatial organization of the codon informative properties

Autores:  Rapacioli Melina, Katz Ricardo, Flores Vladimir

Resumen: Describe la “lógica” implícita en el código genético estándar. Las bases son consideradas entidades fisicoquímicas que poseen dos propiedades esenciales: (a) tipo molecular y (b) número de puentes de hidrógeno involucrados en las interacciones específicas codón-anticodón. En dicho trabajo mostramos que la estructura del codón posee una doble función informativa: (a) por un lado determina su carácter discriminante o no-discriminante y (b) por otro, determina un aminoácido específico. Estos dos aspectos constituyen la información global del codón.
El trabajo presenta dos conjuntos diferentes de reglas para describir estos diferentes fenómenos. Se ha establecido que, dependiendo del tipo de base que ocupa la segunda posición, sólo dos o tres de las seis propiedades de los codones situadas en posiciones definidas determinan el comportamiento discriminante o no-discriminante. Con respecto a la función determinante de los aminoácidos, para diferentes conjuntos de codones sinónimos (singletes, dobletes, tripletes, cuadrupletes y sextetos) el número de propiedades informativas que integran el codón y sus posiciones típicas cambian característicamente.
En base a las reglas presentadas se puede postular que un codón puede definirse como una entidad informativa asimétrica, cuya capacidad informativa global resulta de la combinatoria espacialmente organizada de las seis propiedades asignadas por las tres bases.

Disponible en: Frontiers